«Clausura 2009». Los resultados mejoraron debido al buen juego que proponía el equipo; de esta manera alcanza el 9° puesto y logra salvarse del descenso directo y de la promoción tras un gran triunfo en Mendoza contra River Plate, camiseta juventus después del triunfo el Tomba aseguró su permanencia en primera. Godoy Cruz tuvo que disputar la promoción para mantener la categoría frente a Huracán en que pierde ambos encuentros -0-2 en Parque Patricios y 2-3 en Mendoza- y el día 24 de junio de 2007 desciende de categoría, volviendo a jugar en la «B Nacional».
